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尾叶桉响应水肥单、双因素胁迫的差异表达基因分析
尾叶桉响应水肥单、双因素胁迫的差异表达基因分析
作者:
廖焕琴
张卫华
徐放
杨会肖
杨晓慧
潘文
黄杰
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
尾叶桉
水肥双因素胁迫
单因素胁迫
转录组
差异表达基因
qRT-PCR
摘要:
[目的]比较尾叶桉Eucalyptus urophylla对水肥单、双因素胁迫的分子响应机制,为桉树抗逆育种提供思路和分子基础.[方法]以无性系ZQUA44为试验材料,设3个水肥胁迫处理和1个对照(CK).水肥双因素胁迫:20%~40% 田间持水量,基肥[钙镁磷肥(CMPF)250 g];水分单因素胁迫:20%~40% 田间持水量,基肥(CMPF 250 g+复合肥150 g);养分单因素胁迫:60%~80% 田间持水量,基肥(CMPF 250 g);CK:60%~80% 田间持水量,基肥(CMPF 250 g+复合肥150 g).水分单因素胁迫和对照在种植2个月后施尿素100 g,8月份施复合肥150 g,第2年春天施复合肥100 g.对受胁迫处理的尾叶桉进行生长指标测定,并取叶片进行转录组测序,对测序结果进行拼接,利用生物信息学手段获得差异表达基因,对差异基因进行GO功能注释和KEGG通路分析.最后随机选择4个具有不同表达模式的差异表达基因进行qRT-PCR,验证转录组测序数据的可信度.[结果]3种胁迫处理均在一定程度上抑制尾叶桉的生长发育,胁迫处理下尾叶桉各项生长指标多显著低于对照.水肥双因素胁迫、水分单因素胁迫和养分单因素胁迫处理共得到5547个差异表达基因,分别有2585、1472和1490个差异表达基因,各有1195、222和665个基因表达上调和1390、1250和825个基因表达下调;3种胁迫处理分别获得155、75和108个基因编码转录因子.水肥单、双因素处理的差异表达基因均显著富集在苯丙烷的生物合成路径中.qRT-PCR结果与转录组测序结果基本一致,说明测序结果可信.[结论]尾叶桉在3种胁迫处理下的转录变化具有明显的普遍性和特异性,综合胁迫对植物生长的影响比单独胁迫的影响更大,不同胁迫条件下植物可能具有不同的响应方式.
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文献信息
篇名
尾叶桉响应水肥单、双因素胁迫的差异表达基因分析
来源期刊
华南农业大学学报
学科
农学
关键词
尾叶桉
水肥双因素胁迫
单因素胁迫
转录组
差异表达基因
qRT-PCR
年,卷(期)
2020,(5)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
73-81
页数
9页
分类号
S718.46|Q943.2
字数
6860字
语种
中文
DOI
10.7671/j.issn.1001-411X.202002002
五维指标
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水肥双因素胁迫
单因素胁迫
转录组
差异表达基因
qRT-PCR
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研究来源
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研究去脉
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期刊影响力
华南农业大学学报
主办单位:
华南农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1001-411X
CN:
44-1110/S
开本:
大16开
出版地:
广州五山华南农业大学学报编辑部
邮发代号:
创刊时间:
1959
语种:
chi
出版文献量(篇)
2705
总下载数(次)
5
总被引数(次)
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