茜素红诱导下偏肿革裥菌SSH-cDNA文库构建与差异表达基因筛选

• 作者: 韩树英 池玉杰 张健 冯连荣
• 来源期刊: 吉林农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 偏肿革裥菌 抑制性差减杂交 差异表达基因 氧化还原酶 热激蛋白
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 页码范围: 386-394
• 页数: 9页
• 分类号: S718.81|Q78
• 语种: 中文
• DOI: 10.13327/j.jjlau.2019.5073

摘要

为了探索白腐菌偏肿革裥菌降解染料茜素红过程中的生理机制和差异表达基因,在LNAS培养基上培养菌株,以添加茜素红为处理组,加入无菌水为对照组,采用抑制性消减杂交方法构建了在染料降解过程中的差异基因cDNA文库.经过2次差减杂交后所得的阳性克隆,除去重复序列后得到75个独立基因的ESTs序列,即为差异基因的SSH-cDNA文库.文库中显著表达的差异基因主要有编码谷氨酰胺合成酶、热激蛋白70、α,β-水解酶、脯氨酰氨肽酶-2、MFS普通基质转运蛋白、钙网结构域蛋白、20S蛋白酶体亚基α型3、3-脱氧-7-磷酸庚酮糖合酶、醛酮还原酶、脂肪酸2-羟化酶、辅酶Ⅰ黄素氧化还原酶、细胞色素P450等基因,这些差异基因及其产物参加了茜素红的氧化降解反应、糖类和蛋白质的降解作用、应激反应和信号转导途径.此研究结果可为进一步筛选偏肿革裥菌中与染料降解性状相关的基因奠定基础.