基于高通量测序技术分析生物质炭可溶性组分处理 不结球白菜叶片的转录组学分析

• 作者: 刘晓雨 卞荣军 张旭辉 时薇 李恋卿 潘根兴 郑聚锋
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 不结球白菜 可溶性组分 基因差异表达 高通量测序 转录组分析
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 生物与环境
• 页码范围: 674-681
• 页数: 8页
• 分类号: S158.3
• 字数: 8363字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201908019

摘要

[目的]本文旨在探究生物质炭表面可溶性组分对作物生长的潜在作用机制.[方法]采用新一代高通量测序手段——RNA-Seq技术对添加生物质炭可溶性组分处理和未添加可溶性组分的不结球白菜叶片进行转录组分析,研究其差异基因的功能,并利用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)对关键基因进行检测验证.[结果]添加生物质炭可溶性组分的不结球白菜叶片中共检测到499个差异基因,其中上调表达基因152个,下调表达基因347个.RT-qPCR验证分析与转录组测定结果一致.基因功能注释显示差异基因多集中于细胞壁的多糖代谢和碳水化合物代谢等生物过程,主要调控果胶裂解酶、果胶甲酯酶、葡糖基转移酶等活性.[结论]果胶裂解酶和果胶甲酯酶同源基因的下调表达、葡糖基转移酶活性同源基因的上调表达证实生物质炭可溶性组分可以在增加植物细胞壁稳定性的同时提高作物对逆境条件的抵抗能力,从基因表达的角度揭示了生物质炭可溶性组分对不结球白菜的影响.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李恋卿	南京农业大学农业资源与生态环境研究所	130	6903	46.0	81.0
2	张旭辉	南京农业大学农业资源与生态环境研究所	63	3424	27.0	58.0
3	郑聚锋	南京农业大学农业资源与生态环境研究所	17	786	9.0	17.0
4	刘晓雨	南京农业大学农业资源与生态环境研究所	16	374	8.0	16.0
5	卞荣军	南京农业大学农业资源与生态环境研究所	7	11	2.0	3.0
6	时薇	南京农业大学农业资源与生态环境研究所	1	0	0.0	0.0