花生Argonaute基因家族全基因组鉴定与表达模式分析

• 作者: 单世华 孙全喜 张浩 李春娟 王娟 苑翠玲 赵小波 闫彩霞 陆晓东
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: AGO蛋白 花生 表达模式分析
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·生物技术
• 页码范围: 767-777
• 页数: 11页
• 分类号: S565.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.19802/j.issn.1007-9084.2020045

摘要

AGO蛋白(Argonaute protein)是RNA诱导沉默复合体的关键组分,在植物生长发育中发挥重要作用.花生基因组测序的完成为全基因组水平上分析AGO抗病基因提供了条件.利用AGO蛋白的保守域在花生基因组数据库与NCBI中进行同源比对,鉴定得到花生AGO基因家族所有成员.我们基于生物信息学对AGO蛋白家族的进化关系、理化性质、染色体定位、基因结构、结构域、不同组织中和胁迫下的表达模式等进行分析.结果 表明:试验共鉴定得到51个花生AGO基因,包括12个A.duranensis基因,12个A.ipaensis基因以及27个栽培种花生AGO基因.染色体定位分析结果显示这些基因不均匀地分布在花生染色体上,且A.duranensis与A.ipaensis基因组上有10对成员存在较为明显的同源关系.表达模式分析表明AdAGO2、AiAGO4、AdAGO3、AiAGO7、AdAGO8、AiAGO8基因在花生22个组织中整体表达量偏高;而花生茎尖(Shoot Tip)与雄蕊(Stamens)中AGO基因家族呈现较高表达量.本研究结果为揭示AGO蛋白功能和发掘花生的抗逆育种靶向基因资源提供了一定的理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	闫彩霞		42	238	10.0	13.0
2	李春娟		45	478	11.0	21.0
3	单世华		70	734	15.0	24.0
4	赵小波		16	39	5.0	5.0
5	王娟		15	27	3.0	5.0
6	张浩		7	14	2.0	3.0
7	孙全喜		34	140	8.0	10.0
8	陆晓东		1	0	0.0	0.0
9	苑翠玲		7	2	1.0	1.0