有害藻华的宏条形码分析:机会与挑战

• 作者: 陈楠生
• 来源期刊: 海洋科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 有害藻华物种 分子标记 可操作分类单元 扩增子序列变异 宏条形码分析 生物地理学
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 研究综述
• 页码范围: 116-134
• 页数: 19页
• 分类号: Q948.8|Q14
• 语种: 中文
• DOI: 10.11759/hykx20200310001

摘要

宏条形码分析(metabarcoding analysis)是通过对野外样本的分子标记(即条形码)进行PCR扩增、测序,并利用测序结果分析野外样本物种组成、物种相对丰度,及其时空动态变化.这项在近20年里逐步发展起来的分子技术,得益于DNA测序技术的快速发展,包括测序通量的提升和测序成本的降低,以及生物信息学分析方法的快速开发.基于可操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs)分析方法,特别是最近的扩增子序列变异(amplicon sequence variants,ASVs)方法的开发,极大促进了宏条形码分析的应用.在世界及我国的海洋生态领域,宏条形码分析的应用还处于起步阶段.随着分析方法的日趋成熟,可适用于不同应用领域的分子标记不断增加,以及参考数据库的不断完善,宏条形码分析将释放出广阔的应用潜力.可以预期,宏条形码分析将在系统分析我国近岸海域有害藻华物种(及其他浮游生物物种)的组成和相对丰度中起关键作用,通过发现新物种,辨别隐存种,跟踪物种的生物地理学,进而帮助解析有害藻华暴发机理.