药用植物珊瑚菜GlAT基因的克隆和生物信息学分析

• 作者: 任宏伟 孟寒寒 徐瑶 赵永丽 高婷
• 来源期刊: 世界中医药
• 学科: 医学
• 关键词: 药用植物 珊瑚菜 转录组 酰基转移酶 基因筛选 克隆 生物信息学分析 次生代谢
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 专题——中药资源与本草基因组学
• 页码范围: 683-688
• 页数: 6页
• 分类号: R284
• 字数: 5053字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-7202.2020.05.005

摘要

目的:对药用植物珊瑚菜Glehnia littoralis BAHD酰基转移酶(Acyltransferase,AT)基因序列进行生物信息学分析.方法:用茉莉酸甲酯(MeJA)处理珊瑚菜幼苗,用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)方法检测GlAT候选基因的表达量,在已建立的珊瑚菜转录组数据中筛选出表达量较高且MeJA处理后上调表达的1条GlAT基因序列,对该基因cDNA序列进行全长克隆;根据所得的氨基酸序列进行蛋白质理化性质、二级结构、三级结构分析,利用MEGA 6.0构建该蛋白序列的NJ系统进化树.结果:GlAT的全长开放阅读框ORF(Open Reading Frame)为1 443 bp,编码480个氨基酸.该蛋白相对分子质量为52 844.14,等电点为6.92,为亲水性蛋白,属于转移酶超家族.珊瑚菜GlAT蛋白与同科植物胡萝卜Daucus carota subsp.sativus的AT蛋白亲缘关系最近.结论:首次获得珊瑚菜GlAT基因的ORF全长序列并进行了生物信息学分析,为进一步开展该基因的功能和遗传调控机制研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高婷	青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物重点实验室	13	41	4.0	5.0
2	任宏伟	青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物重点实验室	2	0	0.0	0.0
3	孟寒寒	青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物重点实验室	1	0	0.0	0.0
7	徐瑶	青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物重点实验室	1	0	0.0	0.0
8	赵永丽	青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物重点实验室	1	0	0.0	0.0