磷酸三苯酯致大鼠肝脏代谢紊乱的生物信息学分析

• 作者: 丁元林 于海兵 王姝 胡维
• 来源期刊: 环境与职业医学
• 学科: 医学
• 关键词: 磷酸三苯酯 生物信息学 代谢紊乱 昼夜节律 Arntl基因
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 原创精选
• 页码范围: 111-120
• 页数: 10页
• 分类号: R114
• 语种: 中文
• DOI: 10.13213/j.cnki.jeom.2020.19501

摘要

[背景]磷酸三苯酯(TPHP)是目前应用最广泛的有机磷酸酯类阻燃剂之一,已在多种环境介质中被检测到.由于该化合物的多重毒性,近年来TPHP的健康风险引起了广泛的关注.然而,有关TPHP暴露对肝脏代谢影响的研究较少.[目的]基于转录组测序数据,采用生物信息学方法探讨TPHP暴露对大鼠肝脏代谢紊乱的效应.[方法]基于基因表达数据库(GEO)获得基因表达谱数据集.采用主成分分析和层次聚类分析方法,依据不同剂量组的基因表达模式的相似程度将样本归类至对照组(0 mg·kg-1,含5个样本)、低剂量组(55.0、110.0、220.0 mg·kg-1,含9个样本)和高剂量组(441.0、881.0 mg·kg-1,含6个样本);利用R3.5.3软件中limma包筛选差异表达基因(DEGs).运用clusterProfiler包对DEGs进行基因本体(GO)、京都基因和基因组数据库(KEGG)富集分析.利用STRING网络数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并运用Cytoscape 3.7.1软件的网络分析插件CytoHubba筛选中心基因.最后,运用clusterProfiler包对重要的中心基因进行基因集富集分析(GSEA).[结果]与对照组相比,低剂量组DEGs共53个,其中表达上调的基因30个,表达下调的基因23个;而高剂量组DEGs共151个,其中表达上调的基因80个,表达下调的基因71个.GO和KEGG富集分析显示,两个剂量组与对照组的DEGs富集的功能相似,主要涉及昼夜节律、碳水化合物代谢、脂质代谢、氨基酸代谢、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路等生物学途径.PPI网络分析和GSEA显示,Arntl基因是唯一一个在低、高剂量组PPI网络中都存在的中心基因,Arntl基因低表达、高表达组分别在6、19条通路上富集,并且其高表达富集于不饱和脂肪酸的生物合成、PPAR信号通路等生物学途径.[结论]TPHP可诱导大鼠肝脏中昼夜节律、碳水化合物、脂质和氨基酸代谢途径受到干扰.节律基因Arntl可能在TPHP暴露导致的肝脏代谢紊乱中发挥重要作用,并影响内分泌功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	于海兵	广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室	6	21	2.0	4.0
2	丁元林	广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室	11	34	4.0	5.0
3	胡维	广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室	2	0	0.0	0.0
4	王姝	广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室	1	0	0.0	0.0