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燕山葡萄MAPK基因的克隆、亚细胞定位及表达分析
燕山葡萄MAPK基因的克隆、亚细胞定位及表达分析
作者:
张庆田
朱自果
李勃
李桂荣
李秀杰
韩真
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
燕山葡萄
MAPK基因
生物信息学分析
表达分析
摘要:
促分裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)级联途径在植物的生长发育和应答逆境的信号传导中起着重要作用,但有关MAPK家族成员在中国野生葡萄(Vitis sp.)中的作用研究较少.本研究从中国野生燕山葡萄(Vitis yeshanesis)中获得2条MAPK新基因VyMAPK2和VyMAPK3(GenBank No.MK942078;MK942077),对其进行生物信息学及亚细胞定位分析,并进行生长调节剂及干旱、高盐和低温等逆境处理下的表达分析.VyMAPK2和VyMAPK3蛋白序列中包含MAPK家族所特有的11个保守蛋白激酶亚结构域、TEY基序、活化环(activition-loop)、停靠区域(common docking domains)、磷酸化环(P-loop)和催化位点(C-loop)等结构域,分别归属于MAPK家族的B和A亚家族.亚细胞定位分析表明,VyMAPK2蛋白主要分布在细胞核,VyMAPK3蛋白也主要分布在细胞核,但在细胞质中也有分布基因表达分析显示,VyMAPK2表达量在根中最高,VyMAPK3表达量在叶中最高;生长调节剂处理下,生长素、赤霉素、细胞分裂素、乙烯、脱落酸、水杨酸和茉莉酸甲酯均能够显著诱导VyMAPK3基因的表达(P<0.05),而VyMAPK2的表达变化不明显;在逆境下,干旱、高盐和低温均能够显著诱导VyMAPK3基因的表达(P<0.05),而VyMAPK基因仅受干旱的诱导.以上结果表明,VyMAPK3基因在燕山葡萄生长发育和抵御外界逆境胁迫方面起着重要的作用,此研究有助于了解中国野生葡萄的抗逆机制,为葡萄抗逆育种提供基因资源.
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基因
计算生物学
基因表达谱
亚细胞部分
内容分析
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文献信息
篇名
燕山葡萄MAPK基因的克隆、亚细胞定位及表达分析
来源期刊
农业生物技术学报
学科
农学
关键词
燕山葡萄
MAPK基因
生物信息学分析
表达分析
年,卷(期)
2020,(3)
所属期刊栏目
研究论文与报告
研究方向
页码范围
429-440
页数
12页
分类号
S663.1
字数
7183字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2020.03.006
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李勃
104
646
15.0
21.0
2
李桂荣
河南科技学院园艺园林学院
92
466
12.0
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3
韩真
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78
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李秀杰
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张庆田
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朱自果
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燕山葡萄
MAPK基因
生物信息学分析
表达分析
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研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
8
总被引数(次)
40364
相关基金
河南省自然科学基金
英文译名:
官方网址:
http://kyc.hncj.edu.cn/gzzd/gzzd56.htm
项目类型:
学科类型:
期刊文献
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