基于生物信息学方法探讨胃癌组织中miR-195的表达及临床意义

• 作者: 卢黎琦 杨倩 杨莉 陈利贞 黄远帅
• 来源期刊: 标记免疫分析与临床
• 学科: 医学
• 关键词: 微小RNA195 胃癌 生物信息学 诊断
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 805-812,855
• 页数: 9页
• 分类号: Q811.4|R735.2
• 字数: 2951字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11748/bjmy.issn.1006-1703.2020.05.020

摘要

目的 通过生物信息学方法探讨miR-195在胃癌组织中的表达情况及其临床意义.方法 下载GEO和TCGA数据库中相关数据集,比较胃癌组织和正常胃组织中miR-195表达量,并分析miR-195表达量与胃癌患者临床特征的相关性.采用生物信息学方法预测miR-195的靶基因,利用R软件的“ClusterProfiler”包对靶基因进行GO和KEGG富集分析,通过STRING 11.0在线分析网站构建PPI网络,进一步筛选出miR-195的核心基因.结果 miR-195在胃癌组织中的表达水平低于正常胃组织,且对于胃癌具有较高的诊断价值(AUC＞ 0.7,P＜0.05);miR-195表达量与患者年龄、病理分级、TNM分期和淋巴结转移等密切相关(P＜0.05).GO分析显示,miR-195的靶基因主要富集在离子通道及转运蛋白、细胞发育等功能,KEGG分析主要涉及胃酸分泌、钙信号通路等.AFP、CDC6和COL1 A1为PPI网络中的核心基因,在胃癌中均表达上调,其中AFP和CDC6与miR-195表达量呈负相关(P＜0.05).结论 miR-195在胃癌组织中低表达,可作为抑癌基因参与胃癌的发生发展,并有潜力成为胃癌的诊断标志物及治疗靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄远帅	西南医科大学附属医院输血科	45	70	4.0	6.0
2	杨倩	西南医科大学附属医院输血科	21	5	2.0	2.0
3	杨莉	西南医科大学附属医院输血科	9	0	0.0	0.0
4	陈利贞	西南医科大学附属医院产前诊断中心	2	0	0.0	0.0
5	卢黎琦	西南医科大学附属医院输血科	1	0	0.0	0.0