局灶性皮质发育不良基因表达的生物信息学及药物分析

• 作者: 佘颖芳 周列民 赵怡然 陈傲寒 陈树达 黎银潮
• 来源期刊: 中风与神经疾病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 生物信息学 局灶性皮质发育不良 基因芯片 药物
• 年，卷（期）: 2020,（10）
• 所属期刊栏目: 论著与经验总结
• 页码范围: 872-876
• 页数: 5页
• 分类号: R742.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.19845/j.cnki.zfysjjbzz.2020.0474

摘要

目的 局灶性皮质发育不良(focal cortical dysplasias,FCD)的发病分子机制尚不明确,因此本研究的目的是发现潜在的基因标记及其靶向药物,为FCD的进一步研究奠定基础.方法 (1)从基因芯片公共数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中搜索下载FCD相关基因芯片数据集(GSE62019),含有5例FCD患者和3例对照组的脑组织标本.筛选和鉴定FCD的差异表达基因,利用DAVID在线网站分析基因本体论以及构建DEGs间的相互作用网络,选择重要的基因模块进行深入分析并筛选出5个与周围基因高度相关的基因作为核心基因.最后,筛选以这些核心基因为靶点的现有药物.结果 (1)在GSE62019筛选出777个DEGs,分别包括364下调基因和413个上调基因.筛选出DEGs中的1个核心模块以及挑选出5个核心基因(C3、SAA1、ANXA1、CXCL2和CCL25)以及这些基因相关的现有靶向药物.结论 通过生物信息学分析表明FCD的发病机制错综复杂,本研究对进一步探究FCD的发病机制以及确定新的候选治疗靶点和筛选靶向药物具有重要意义.