玉米GATA基因家族的全基因组鉴定及热胁迫下的表达分析

• 作者: 周波 王延召 王淑凤 程军玲 聂利红 韩小花 鲁晓民 黄保
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 GATA基因家族 全基因组鉴定 热胁迫 基因表达
• 年，卷（期）: 2020,（11）
• 所属期刊栏目: 作物栽培·遗传育种
• 页码范围: 19-25
• 页数: 7页
• 分类号: S513
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2020.11.003

摘要

利用生物信息学方法对玉米基因组中的GATA基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、染色体分布、系统进化、基因结构、保守基序进行分析,并分析其在热胁迫前后的表达水平变化,以期为玉米GATA基因功能研究奠定基础.结果表明,在玉米基因组中共鉴定到37个GATA基因,它们不均匀地分布在10条染色体上,均含有CX2 CX18 CX2 C保守基序;进化树分析表明,玉米GATA基因家族可分为A、B、C、D 4组,分别包含21、10、4、2个基因,同一组内的基因具有相似的基因结构.热胁迫处理后,玉米GATA家族成员中表达上调的基因有9个,包含A组5个(Zm00001d010785、Zm00001d023539、Zm00001d041883、Zm00001d025953、Zm00001d031135),B组2个(Zm00001d011771、Zm00001d034751),C组2个(Zm00001d036494、Zm00001d014656);下调的基因有2个,均属于B组(Zm00001d016361和Zm00001d009193).说明上调表达的这9个GATA基因在应答热胁迫过程中可能发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周波		29	136	7.0	10.0
2	王延召		11	49	4.0	7.0
3	聂利红		15	36	3.0	5.0
4	韩小花		11	22	3.0	4.0
5	鲁晓民		24	88	4.0	9.0
6	黄保		7	47	3.0	6.0
7	程军玲		4	0	0.0	0.0
8	王淑凤		1	0	0.0	0.0