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芒果中性/碱性转化酶MiNI基因的克隆与表达分析
芒果中性/碱性转化酶MiNI基因的克隆与表达分析
作者:
冯学杰
华敏
罗志文
胡福初
范鸿雁
邓会栋
郭利军
陈哲
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
芒果
中性/碱性转化酶
克隆
生物信息学
表达分析
摘要:
采用RT-PCR技术克隆了1个编码NI基因的cDNA序列,命名为MiNI基因,并对不同来源的中性/碱性转化酶的分子特征及系统进化进行比较分析.结果 表明:MiNI基因开放阅读框为2034 bp,编码677个氨基酸,相对分子量为76.6kDa,理论等电点为6.24;生物信息学分析结果显示,NI二级结构α螺旋占38.85%,无规则卷曲占35.45%,伸展链占18.91%,β折叠占6.79%;MiNI具有glycoside hydrolase family 100结构保守域,与克里曼丁桔、龙眼、巴西橡胶树和番木瓜都具有一致的motif位点;MiNI基因编码的氨基酸序列与克里曼丁桔、龙眼氨基酸序列同源性最高;构建NI系统进化树分析表明,与芒果遗传距离最近的是克里曼丁桔,最远的是玉米和枸杞.qRT-PCR分析显示,果皮MiNI基因表达量远高于果肉;花后10~40 d,果皮MiNI基因表达量显著下降﹔花后40~100 d,果皮MiNI基因表达量维持在一个相对稳定水平;花后100~130 d,随着果实成熟,果皮MiN基因表达量又显著上升;而花后10~40 d,果肉MiNI基因表达量显著下降,至果实发育后期果肉MiNI基因表达量始终处于极低水平.该研究为进一步了解MiNI基因在芒果果实蔗糖代谢过程中的作用以及从分子角度阐明芒果糖代谢机理奠定理论和技术基础.
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篇名
芒果中性/碱性转化酶MiNI基因的克隆与表达分析
来源期刊
热带作物学报
学科
农学
关键词
芒果
中性/碱性转化酶
克隆
生物信息学
表达分析
年,卷(期)
2020,(9)
所属期刊栏目
组学与生物技术
研究方向
页码范围
1741-1747
页数
7页
分类号
S667.7|S961.6
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-2561.2020.09.003
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热带作物学报
主办单位:
中国热带作物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-2561
CN:
46-1019/S
开本:
大16开
出版地:
海南省海口市龙华区学院路4号
邮发代号:
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
5760
总下载数(次)
12
总被引数(次)
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