甘薯花青素合成酶(ANS)基因的克隆及其组织表达模式分析

• 作者: 杨慧珍
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: ANS 甘薯 生物信息学分析 组织表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（11）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 1718-1723
• 页数: 6页
• 分类号: S531
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2020.11.04

摘要

从NCBI数据库中检索得到甘薯ANS序列,利用同源比对在前期转录组数据库中筛选获得同源序列,通过PCR反应克隆出甘薯ANS基因(IbA NS)的cDNA全长序列,进而预测和分析IbANS基因的蛋白质序列,同时对其在不同甘薯品种的不同组织进行了实时定量PCR分析.结果 表明,该cDNA具有最大开放阅读框(ORF),共1 086个碱基,编码362个氨基酸残基;ANS蛋白为亲水性蛋白质,不存在信号肽;保守结构域预测分析表明,该基因编码的蛋白具有典型的ANS蛋白功能结构域,属于2OG-FeII_Oxy双加氧酶超家族;系统进化树分析显示,甘薯ANS与三浅裂野牵牛亲缘关系最近;荧光定量PCR结果表明,IbA NS在紫心甘薯块根中高表达.研究结果可为进一步阐明IbA NS基因在紫心甘薯块根中的形成及累积机制提供理论基础.