水牛miRNA-155重组腺病毒载体的构建及生物信息学分析

• 作者: 俸云 冯万有 卢嘉卡 吴飞 沈朋雷 王露露 石德顺 陆凤花 陈维丽
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水牛 miR-155 卵丘细胞 生物信息学 腺病毒载体
• 年，卷（期）: 2020,（10）
• 所属期刊栏目: 基础兽医学
• 页码范围: 1998-2006
• 页数: 9页
• 分类号: S852.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2020.10.19

摘要

旨在利用Admax系统构建miRNA-155的腺病毒表达载体,获得含有miR-155的腺病毒颗粒,同时对miR-155的预测靶基因进行生物信息学分析,为研究水牛卵丘细胞中miRNA-155的功能奠定基础.根据GenBank中牛的序列,通过RT-PCR扩增得到pri-miRNA-155序列,并连接到腺病毒载体pDC316-mCMV-EGFP,测序并进行生物信息学分析.将pDC316-mCMV-EGFP-pri-miRNA-155与pBHGloxdelE13cre在HEK-293细胞中包装获得Ad-miRNA-155病毒颗粒,感染水牛卵丘细胞后,利用RT-qPCR技术检测miRNA-155及部分靶基因表达量.TargetScan网站预测获得miRNA-155的靶基因,并利用KOBAS 3.0对预测靶基因进行GO和KEGG富集分析.结果 表明,成功构建腺病毒重组载体pDC316-mCMV-EGFP-pri-miRNA-155,水牛pre-miR-155与黄牛、马、家兔、原鸡、猕猴、狼、树鼩的同源性均达95％以上,且miR-155在进化过程中高度保守.Ad-miR-155感染水牛卵丘细胞后,miR-155的表达水平显著上升(P＜0.01),预测靶基因Wee1、CD44、TRPS1表达水平显著降低(P＜0.01).最后对miR-155预测靶基因进行生物信息学分析发现,miR-155可能通过PI3K-AKT、mTOR及MAPK等信号通路作用于卵丘细胞进而调控水牛卵母细胞体外成熟.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	石德顺		241	1058	14.0	21.0
2	陆凤花		61	253	9.0	13.0
3	俸云		3	0	0.0	0.0
4	沈朋雷		4	1	1.0	1.0
5	王露露		8	41	1.0	6.0
6	吴飞		4	1	1.0	1.0
7	陈维丽		2	0	0.0	0.0
8	冯万有		1	0	0.0	0.0
9	卢嘉卡		1	0	0.0	0.0