基于生物信息学分析F13A1基因及蛋白质

• 作者: 杨健康 王淮
• 来源期刊: 医学信息
• 学科: 医学
• 关键词: F13A1 启动子 蛋白质 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（11）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 52-57
• 页数: 6页
• 分类号: R394.3
• 字数: 2922字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-1959.2020.11.017

摘要

目的 利用生物信息学方法 对F13A1及其编码蛋白质进行分析,为F13A1的实验研究提供理论基础和新线索.方法 从UCSC(http://genome.ucsc.edu/index.html)数据库检索"F13A1",下载F13A1蛋白序列,截取转录起始点上游2000 bp碱基序列作为启动子区域进行分析,分析F13A1编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、信号肽和跨膜区域、蛋白质结构、相互作用网络及GO注释.结果 F13A1包含多个启动区域,不存在CpG岛,但存在SRF、Sp1和AP-1等转录因子结合位点.F13A1编码蛋白是由732个氨基酸组成的无信号肽、无跨膜区域的亲水蛋白,其主要定位于细胞核,二级结构以随机卷曲为主.另外蛋白F13B、FGA、FGG、F2、FGB、FN1、SERPINF2、VWF、VEGFA、F5可能与F13A1存在相互作用.结论 F13A1基因存在多个启动子区域,拥有多个转录因子结合位点;F13A1蛋白与F13B、FGA、FGG、F2等多个蛋白质相互作用,其参与组成内质网腔、血小板α颗粒内腔以及细胞内细胞器腔等多种细胞成分,同时在血液凝固、纤维蛋白溶解和血小板活化等多种生理过程发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨健康	大理大学基础医学院	4	1	1.0	1.0
2	王淮	大理大学基础医学院	3	0	0.0	0.0