基于共表达网络分析的Ⅰ期胃癌预后基因筛选

• 作者: 宫丽宝 张朝旭 张闯 曲秀娟 李智 杨博文 礼想 臧丹
• 来源期刊: 中国医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 胃癌 脑酸可溶性蛋白1 加权基因共表达网络分析 转移
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1-8
• 页数: 8页
• 分类号: R735.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.12007/j.issn.0258-4646.2021.01.001

摘要

目的 基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选Ⅰ期胃癌(SIGC)的预后因子并探讨其分子机制.方法 通过WGCNA分析癌症基因组图谱(TCGA)中SIGC患者的临床数据,筛选影响SIGC预后的基因,并通过体外实验验证该基因对预后的影响.通过基因组富集分析(GSEA)进一步探索其影响胃癌预后的机制.结果 TCGA中共有胃癌数据330例,其中SIGC数据51例.脑酸可溶性蛋白1(BASP1)基因高表达患者的总生存期(OS)明显短于低表达患者(P=0.01625).体外研究显示,抑制BASP1表达后,胃癌细胞迁移能力降低了62.2％.BASP1高表达富集了与肿瘤密切相关的IL6-JAK-STAT3通路(NOM p-val<0.001;FDR q-val<0.001).结论 BASP1是SIGC的预后不良因子.BASP1可能通过调节IL6-JAK-STAT3通路促进胃癌细胞的迁移而导致胃癌预后不良.