白及MSI1基因的序列分析及SSR多态性分析

• 作者: 黄恻隐 赵永彬 陈荣辉 李林 闻伟锷 徐德林
• 来源期刊: 生物资源
• 关键词: 白及 MSI1基因 结构与功能 生物信息学分析 简单重复序列
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 专栏 中药材资源
• 页码范围: 218-224
• 页数: 7页
• 分类号: S567.239
• 语种: 中文
• DOI: 10.14188/j.ajsh.2021.03.003

摘要

通过对白及(Bletilla striata(Thunb.)Rchb.f.)的IRA1多拷贝抑制子(multicopy suppressor of IRA1,MSI1)基因序列进行生物信息学分析,并根据其核苷酸序列设计简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)引物,进一步验证其在多个白及地方种中高度的保守性.运用Protparam、SOPMA、SWISS-MODEL等生物信息学软件分析白及MSI1蛋白的理化性质和结构域;DNAMAN、MEGA软件分别进行氨基酸多序列比对与系统进化分析;分析序列中的SSR位点并对多个白及品系进行PAGE检测和验证.结果显示,克隆得到的BSMSI1基因全长为3 700 bp,共编码了 601个氨基酸残基,预测蛋白质分子量为65 309.75 kg/moL,等电点为5.95,表现出高度的保守性,而且发现不同地区的白及BSMSI1基因在遗传上具有多样性.本研究拓展了对BSMSI1序列的认识,新开发标记能有效应用于MSI1基因的检测和育种鉴定,同时也可为其他物种的MSI1基因研究提供参考.