中国对虾NAGase基因SNP标记的筛选及与耐高pH性状的关联分析

• 作者: 何玉英 周雨欣 张海恩 李健 韩旭
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 中国对虾 NAGase基因 耐高pH性状 SNP位点
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 124-133
• 页数: 10页
• 分类号: S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.19663/j.issn2095-9869.20191205003

摘要

为探究N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶基因(NAGase)对中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)耐高pH性状的影响,本研究采用直接测序法及实时荧光定量PCR法检测FcNAGase的多态性,并分析其与中国对虾耐高pH性状的相关性.通过直接测序,在FcNA Gase上共检测到29个潜在的SNP位点,分布频率为1.13/100 bp,其中,内含子的突变频率为0.35/100 bp,外显子的突变发生频率为0.78/100 bp.通过荧光定量PCR方法在中国对虾耐高pH性状分离群体中共检测到14个具有多态性的SNP位点,其中,观测杂合度(Ho)为0.25810.9390,期望杂合度(He)为0.0595～0.4490,多态信息含量(PIC)为0.0574～0.3731;利用卡方检验进行关联性分析,发现2个与中国对虾耐高pH性状显著相关的位点(P＜0.05),分别为P12 (P=0.036)和P27 (P=0.018),本研究结果可为中国对虾分子标记辅助育种研究提供基础数据和方法.