基于TCGA数据库分析PFKFB4在肝细胞癌的临床意义及分子机制

• 作者: 段怡平 陈梁玥 柳家翠 黄奔 程庆元 马甜甜 朱翠雯 秦菲
• 来源期刊: 分子诊断与治疗杂志
• 关键词: 肝细胞癌 PFKFB4 TCGA GSEA 甲基化
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 25-29
• 页数: 5页
• 语种: 中文

摘要

目的 研究6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶4(PFKFB4)在肝细胞肝癌(LIHC)中表达和甲基化与预后的关系,分析PFKFB4在LIHC恶性进展中的作用机制.方法 从TCGA数据库下载LIHC的RNA-seq数据和临床信息,分析比较PFKFB4在LIHC样本和正常样本中的表达差异,利用卡方检验分析PFKFB4与患者临床特征的关系.通过Kaplan-Meier法和Cox风险回归分析PFKFB4在LIHC中的预后价值.利用基因富集分析(GSEA)探索PFKFB4参与的分子通路,并通过MethSurv和TCGA Wanderer等在线数据库分析PFKFB4与LIHC发展有关的甲基化位点.结果 PFKFB4在LIHC样本中的表达水平显著上调,差异有统计学意义(P＜0.05),其表达与患者的Stage分期呈显著负相关(P＜0.05),PFKFB4高表达组的患者总体生存率(OS)比低表达组更差(P＜0.05),可作为LIHC的独立预后因子(HR=1.908,95％CI:1.332～2.733,P＜0.05).GSEA分析结果提示,PFKFB4可能参与糖酵解、细胞自噬和P53等信号通路,并通过PFKFB4的去甲基化调控PFKFB4的表达,影响预后.结论 PFKFB4的低甲基化水平使PFKFB4在LIHC中显著上调,可通过多条分子通路调控LIHC的发生发展,是LIHC的独立预后因子.