不同孵化方式对仔鸡盲肠菌群多样性的影响

• 作者: 陈晓蕾 陈荣 黄瑞玲 许丽惠
• 来源期刊: 福建畜牧兽医
• 关键词: 仔鸡 肠道菌群多样性 孵化方式 高通量测序
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 调查研究
• 页码范围: 6-14
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-4331.2021.03.003

摘要

为了探究孵化方式是否会影响仔鸡盲肠菌群的多样性,本研究将种蛋随机分为两组,分别采用孵化机孵化(J组)和母鸡孵化(M组)两种方式进行孵化.采集出壳前1 d、出壳后7 d和14 d的仔鸡盲肠内容物,基于高通量测序分析菌群多样性的差异.结果显示:出壳前1d的仔鸡盲肠内均未检出菌群.出壳后7d和14d的仔鸡盲肠在门水平上,两个日龄的所有样本具有5个门的菌群,其中优势菌门均为厚壁菌门;而J组厚壁门的丰度均显著高于M组,M1组Campilobacterota门显著高于J1组,M2组变形门显著高于J2组.在纲水平上,所有样本具有9个纲的菌群,优势菌纲为梭菌纲;J1组的梭菌纲极显著高于M1组,而弯曲菌纲极显著低于M1组,M2组有3个菌纲显著高于J2组.在目水平上,共检测到12个菌目,J组的乳杆菌目均显著高于M组.在科水平上,共检测到18个菌科,均检测到丰度较高的毛螺旋菌科、瘤胃菌科,且M组的螺杆菌科、乳杆菌科、肠杆菌科的丰度显著高于J组.在属水平上,J组Ruminococcus_torques_group是优势菌属,M组的粪杆菌属是优势菌属.在种水平上,J组的优势菌种是uncultured_bacterium_g__Ruminococcus_torques_group,M组的优势菌种是uncultured_bacterium_g__Faecalibac-terium,且在M组中检测出幽门螺杆菌和志贺氏菌.可见,不同孵化方式会影响仔鸡肠道菌群的多样性,母鸡孵化的仔鸡肠道菌群丰富度和多样性高于孵化机孵化.