叶用莴苣LsARF1的生物信息学分析及其表达

• 作者: 武扬 姜尚昆 韩春晖 王婷甄 范双喜 郝敬虹
• 来源期刊: 北京农学院学报
• 学科: 农学
• 关键词: 叶用莴苣 LsARF1 生物信息学 表达 分析
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 园艺科学
• 页码范围: 36-41
• 页数: 6页
• 分类号: S636.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13473/j.cnki.issn.1002-3186.2021.0208

摘要

[目的]为了探究LsARF1基因在叶用莴苣抽薹中的作用机制.[方法]采用ProtParam、SignalP4.0、SOPMA、NCBI CD-search、SWISS-MODEL、DNAMAN7.0、MEGA7等生物学软件对其进行生物信息学分析.实时荧光定量PCR分析该基因在不同温度下随时间变化的表达情况.[结果]序列分析表明,该基因的开放阅读框为1968bp,编码656个氨基酸,并保留了ARF结构域.实时荧光定量PCR分析表明,在高温处理下,该基因在易抽薹品种GB-30中表达下调.[结论]LsARF1基因可能在生菜抽薹过程中发挥重要作用.