蒺藜苜蓿CB L基因家族全基因组鉴定及表达分析

• 作者: 张兴政 黄浩捷 孙一闻 程云清
• 来源期刊: 中国草地学报
• 关键词: 蒺藜苜蓿 基因组 CBL 进化分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2021,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-11
• 页数: 11页
• 分类号: Q943.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16742/jz.gcdxb.20200205

摘要

采用生物信息学方法在蒺藜苜蓿全基因组中共筛选得到16条CBL同源序列,基因家族成员在基因组中不均匀分布.蒺藜苜蓿CBL基因均包含内含子和外显子,外显子介于7～10个之间;编码蛋白序列介于202～308个氨基酸之间,含有变异程度不同的3～4个EF-hand结构域;家族成员中共鉴定到5个保守模体,且在N端大多含1～3个豆蔻酰化位点;进化分析发现,基因家族成员可分为3个不同类群,且MtCBL2和MtCBL10在进化过程中存在共线性关系;基因家族成员上游启动子区域存在多种类型植物激素和非生物胁迫响应顺式作用元件,成员间类型和数量存在差异;结合蒺藜苜蓿基因芯片表达数据库分析发现,部分家族成员呈现一定的组织表达特异性,成员在响应干旱和高盐胁迫的过程中表达模式也存在明显差异.