藜麦Hsf家族的进化与多胁迫条件下的转录应答

• 作者: 陈诗佳 张戎金蕾 蒋礼玲 陈志伟 张真真 贾举庆 王明雪 黄胜雄
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 关键词: 藜麦 Hsf 进化 胁迫 转录应答
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 129-136
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.19675/j.cnki.1006-687x.2020.02002

摘要

Hsf转录因子参与调控植物在生物和非生物胁迫下的防御应答机制.基于系统的生物信息学分析方法,对藜麦Hsf家族成员进行序列特征、进化和多种生物和非生物逆境胁迫下的基因表达水平分析.在藜麦基因组中共鉴定得到31个Hsf转录因子,主要分布在7号染色体.系统进化树将藜麦31个Hsf成员划分到A1-A9、B1-B5和C组中;但藜麦Hsf成员在A6、A8、B5亚组中出现了缺失.藜麦Hsf成员的HR-A/B区域蛋白序列比对结果进一步支持了进化树中藜麦Hsf成员的聚类结果.藜麦Hsf成员蛋白序列中保守区域的分布呈现出组别特异性.A组Hsf成员的蛋白序列包括HSF domain、HR-A/B,NLS、NES和CTAD在内的保守区域;B组和C组的Hsf成员则缺失了CTAD.在干旱、高温、盐、低磷胁迫和GCFSV病毒侵染下,31个藜麦Hsf基因的表达模式被阐明;其中大量Hsf基因的表达水平被显著地诱导表达,推测其参与了藜麦在生物和非生物胁迫下的防御应答反应.本研究结果可为藜麦抗逆品种的遗传育种提供大量优良候选Hsf基因.