中华鳖性别差异表达基因比较研究

• 作者: 周先文 王晓清 王佩 江辉 曾丹 彭英海
• 来源期刊: 渔业研究
• 关键词: 中华鳖 性别差异 RNA-Seq 基因
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 论文与报告|Research Paper
• 页码范围: 339-356
• 页数: 18页
• 分类号: S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.14012/j.cnki.fjsc.2021.04.001

摘要

为获得中华鳖(Trionyx sinensis)性别差异表达基因,探索中华鳖性别决定机制,本研究采用RNA-Seq技术测定了中华鳖成熟期精巢和卵巢转录组,分别获得了21494396400 bp和24605142600 bp的clean data.获得总的差异基因10145个,其中在卵巢中表达上调的有4034个,在卵巢中表达下调的有6111个.通过GO、KEGG及蛋白互作分析,在中华鳖性别差异的研究中,获得117个性别表达差异的基因,在雌性中高表达的性别相关基因有Foxl2、Sox3、Sox7、Bmp4、Csf 1、Wnk2、Mtmr4、Gsc、Mr2 f 2、Fgf 9、Tgfβ2、Tgfβ3、Rara、Smd2、Smd3和Smad5等;在雄性中高表达性别相关基因有Dmrt1、Amh、Sox30、Cct4、Cct5、Cldn11、Crem、Dhcr24、Dnai2、Dynll1、Gabarap、Herc4、Her-pud2、Hexb、Hook1、Hormad1和Smc4等;同时Bmp4通过Smad信号通路调控Foxl2的表达,Foxl2基因为中华鳖雌性生理性别的标志基因.