基于TCGA数据库分析富含丝氨酸/精氨酸剪接因子家族在不同癌症中的表达及其预后意义

• 作者: 刘经纬 李浩 任玲 邢承忠
• 来源期刊: 中国医科大学学报
• 关键词: 富含丝氨酸/精氨酸剪接因子 选择性剪接 全肿瘤分析 预后
• 年，卷（期）: 2021,（5）
• 所属期刊栏目: 论著|Original article
• 页码范围: 402-407
• 页数: 6页
• 分类号: R730.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.12007/j.issn.0258-4646.2021.05.004

摘要

目的 揭示不同类型癌症中富含丝氨酸/精氨酸剪接因子?(SRSF)?的整体表达及其对预后的作用.方法 从癌症基因组图谱数据库?(TCGA)?中下载患者SRSF表达和临床信息,分析33种癌症类型中SRSF基因家族的表达差异及预后价值.利用R语言分析SRSF基因表达、突变及其相关细胞信号通路.结果 SRSF在多种癌症中异常表达,并与G2/M检查点、DNA修复、IL-2/STAT5信号转导、缺氧和KRAS多种信号转导通路以及免疫细胞浸润密切相关.SRSF的异常表达与癌症患者的预后显著相关.结论 SRSF基因异常表达可以预测癌症的预后,其可能作为癌症潜在标志物.