拟果蝇钠离子通道基因克隆及其生物信息学分析

• 作者: 邓登辉 段文波 王颢 李芬 吴少英
• 来源期刊: 中国生物防治学报
• 关键词: 拟果蝇 昆虫钠离子通道 基因克隆 选择性剪接 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 研究简报|SCIENTIFIC NOTES
• 页码范围: 340-348
• 页数: 9页
• 分类号: S476
• 语种: 中文
• DOI: 10.16409/j.cnki.2095-039x.2021.03.012

摘要

本文采用RT-PCR技术克隆获得了拟果蝇Drosophila simulans电压门控钠离子通道基因序列,明确其典型特征,分析了进化关系,为拟果蝇抗性分子机理研究奠定基础.克隆得到拟果蝇钠离子通道开放阅读框(GenBank登录号为MT113357),长为6270 bp,编码2090个氨基酸.通过生物信息学分析,发现拟果蝇与黑腹果蝇Drosophila melanogaster钠离子通道基因相似度高达96.86％,与家蝇Musca domestica钠离子通道基因相似度达88.75％,在进化起源上与双翅目果蝇属昆虫有极高的相似度.所克隆出的序列符合昆虫钠离子通道的基本特征,具有DEKA模块和疏水性失活闸门MFM.获得三个选择性剪接(i、a、b)和17个RNA编辑.本文成功克隆拟果蝇钠离子通道基因,对拟果蝇钠离子通道基因进行分析,为研究其抗性机理奠定基础,为农业生产新型药剂的开发提供了新思路.