以CE-PCR产物为模板的STR序列多态分型方法

• 作者: 郭立亮 吴浩 刘宗伟 龚辰宇 张驰 康克莱 韦美甜 孙宏钰 季安全 王乐
• 来源期刊: 中国法医学杂志
• 关键词: 法医遗传学 二代测序 短串联重复序列 序列多态性 毛细管电泳扩增产物
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 263-268
• 页数: 6页
• 分类号: DF795.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13618/j.issn.1001-5728.2021.03.009

摘要

目的 实现以荧光标记复合扩增产物为扩增模板的STR序列多态分型.方法 筛选常用STR分型试剂盒基因座并设计引物,构建常染色体STR复合扩增体系.分别以毛细管电泳(CE)试剂盒GlobalFilerTM、PowerPlex?21和IdentifilerTM Plus的扩增产物为模板,扩增、建库测序及数据分析,评估体系分型准确性及对CE扩增产物的通用性,并与Precision ID GlobalFilerTM NGS STR Panel体系进行比较.结果 该复合扩增体系能够从3款CE试剂盒的扩增产物中获得所有基因座的正确分型和序列多态信息,其体系均衡性和杂合子均衡性亦良好,且均优于Precision ID体系.结论 该复合扩增体系建立了CE技术与二代测序技术之间的桥梁,实现了检材的零利用,能够进一步挖掘荧光标记扩增产物的STR序列多态信息,是对现有技术的提升和有效补充.