结核分枝杆菌Hrp1蛋白的生物信息学分析

• 作者: 刘静 吴芳 张杰 董江涛 柳小玲 梁粟 王菊 张春军 吴江东 章乐 赵海军 张万江
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 关键词: 结核分枝杆菌 Hrp1蛋白 生物信息学 结构
• 年，卷（期）: 2021,（8）
• 所属期刊栏目: 论著|Original Articles
• 页码范围: 669-677
• 页数: 9页
• 分类号: R378.91
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2021.00.081

摘要

目的 应用生物信息学预测分析Hrp1蛋白结构功能和生物学特性.方法 生物信息学软件ORF Finder、SO-SUI、Protpapram、ProtScale、Signal IP、Tmpred、TMHMM、NetNGlyc、NetPhos-3.1-Servera、PSORT、WoLF PSORT、TargetP-2.0-CBS、NLStradamus、SOMPA、SWISS-MODEL、IEDB、SYFPEITHI、RANKPEP、BLAST、DNAStar、STRING对Hrp1蛋白的理化性质、结构功能、生物学特性、抗原表位及蛋白相互作用进行预测分析.结果 Hrp1蛋白原子总数2166,等电点4.96,不稳定性指数19.62,脂肪族氨基酸指数100.35,平均疏水性0.042,有跨膜区无信号肽,1个糖基化位点6个磷酸化位点,二级结构以α-螺旋为主.其亚细胞定位于细胞质,属于稳定的亲水性蛋白.经预测,Hrp1蛋白含有4个B细胞表位,多个T细胞表位,且其相互作用蛋白分别为Rv2627c、Rv2628、Rv1738、devR、Rv2624c、TB31.7、rip3、pfkB、guaA、hspX,并参与多种生物学过程.结论 生物信息学分析Hrp1蛋白为稳定亲水性胞浆蛋白,具有良好的抗原表位,为结核病诊断及治疗的潜在候选因子,是探索结核分枝杆菌持久性感染机制的重要研究靶标,可作为抗结核多肽疫苗的候选蛋白.