斯氏弓形杆菌基于基因组序列遗传特征分析

• 作者: 周贵兰 王园园 顾一心 李颖 鞠长燕 王佳奇 王海瑞 陈晓丽 段永翔 张茂俊
• 来源期刊: 疾病监测
• 关键词: 斯氏弓形杆菌 耐药基因 毒力基因 Ⅵ型分泌系统 种群结构特征
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 实验研究|Experiment Research
• 页码范围: 37-41
• 页数: 5页
• 分类号: R211|R378.2
• 语种: 中文

摘要

目的 获得斯氏弓形杆菌的遗传特征,并对其耐药基因及毒力相关基因进行预测分析.方法 对本实验室分离培养的8株斯氏弓形杆菌进行基因组测序并从NCBI和PATRIC数据库中下载全部已完成基因组测序的15株斯氏弓形杆菌的全基因组序列,应用生物信息学软件对23株不同地域、不同宿主来源的斯氏弓形杆菌进行遗传特征分析.结果 23株斯氏弓形杆菌中仅3株菌携带耐药基因,且均为p-内酰胺类抗生素耐药基因.所有菌株均含有与免疫逃避、侵袭及运动等相关的毒力基因.与其他菌种弓形杆菌常见的10种毒力基因比对分析发现,本研究中所有斯氏弓形杆菌菌株均含有ciaB、tlyA、cj1349、pldA和mviN基因,2株菌(CNAS12-1和F28)含有iroE基因,均不携带另外4种毒力基因.21.7％(5/23)的菌株包含Ⅵ型分泌系统(T6SS)基因簇,且其与弯曲菌属内的T6SS存在基因组成及排列的差异.结论 斯氏弓形杆菌有较高的遗传多样性,部分菌株可能有潜在的耐药和致病特征.