基于网络药理学与分子对接方法的苓甘五味姜辛汤抗新冠肺炎(COVID-19)的作用机制与活性成分研究

• 作者: 杨晶晶 曹灿 崔瑛 史银玥 楚玉玺 巫晓慧
• 来源期刊: 中国医药导刊
• 关键词: 网络药理学 苓甘五味姜辛汤 新冠肺炎 分子对接 SARS-CoV-23CL水解酶 ACE2
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 109-119
• 页数: 11页
• 分类号: R563.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0959.2021.02.007

摘要

目的:采用网络药理学与分子对接法研究苓甘五味姜辛汤抗新冠肺炎(COVID-19)的作用机制与活性成分.方法:借助TCMSP数据库检索苓甘五味姜辛汤的化学成分及成分作用靶点,通过Swiss Target Prediction数据库剔除可能性为0的靶点.以"coronavirus""pneumonia""cough""fever"为检索词在GeneCards及OMIM数据库中检索疾病相应靶点.通过Uniprot数据库校正药物和疾病靶点名称,取苓甘五味姜辛汤与疾病靶点交集,进而运用Cytoscape 3.7.2软件构建中药-化合物-靶点网络进行可视化,用靶点交集通过STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络,DAVID数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,预测交集靶点作用机制,并进行可视化.将中药-化合物-靶点网络中的化合物与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶和血管紧张素转化酶II(ACE2)进行对接,选取与SARS-CoV-23CL水解酶结合能最小的6个化合物作为核心活性成分,做进一步研究.结果:中药-化合物-靶点网络包含了5种中药,67个化合物和靶点141个.PPI网络的关键基因涉及AKT1、MAPK1、MAPK3等,GO功能富集分析得到条目104个,KEGG通路富集分析筛选得到99条信号通路.分子对接结果显示6个核心活性成分甘草异黄烷酮、卡里宾、甘草素L、夏姆比奥纳、光甘草宁、五味子素R,与SARS-CoV-23CL水解酶及ACE2的结合能普遍较推荐化药小.结论:苓甘五味姜辛汤中的化合物能通过与SARS-CoV-23CL水解酶和ACE2结合作用于AKT1、MAPK1、MAPK3等靶点,调节朊病毒病信号通路、非洲淋巴细胞瘤病毒感染通路、小细胞肺癌信号通路和非小细胞肺癌信号通路等发挥抗COVID-19作用.