基于生物信息学数据库的肺腺癌组织中HMGB1表达及相关下游通路分析

• 作者: 任冰洁 杨媛媛 卞徐宇 李强 梁容瑞 陶敏
• 来源期刊: 广西医科大学学报
• 关键词: 高迁移率族蛋白B1 细胞周期蛋白依赖激酶1 H2A组蛋白家族成员Z SOX2 SP1
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 734-740
• 页数: 7页
• 分类号: R734.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16190/j.cnki.45-1211/r.2021.04.018

摘要

目的:通过生物信息技术探讨高迁移率族蛋白B1(HMGB1)促进肺癌进展的潜在关键通路和环节.方法:UALCAN数据库分析HMGB1表达相关的基因和相关基因的生存分析.STRING数据库分析蛋白质—蛋白质相互作用.AnimalTFDB3.0和JASPAR数据库预测转录因子以及结合位点.KEGG数据库分析相关信号通路.结果:生物信息分析结果显示细胞周期蛋白依赖激酶1(CDK1)、H2A组蛋白家族成员Z(H2AFZ)与HMGB1的表达在肺腺癌(LUAD)中呈正相关关系,且CDK1和H2AFZ与LUAD的不良预后有关.预测到SOX2和SP1是CDK1或H2AFZ的转录因子.信号通路分析结果显示Akt和ERK可以调控SOX2的表达.结论:CDK1、H2AFZ可能是HMGB1参与LUAD进展的重要节点,HMGB1-Akt/ERK-SOX2-CDK1/H2AFZ可能是HMGB1促进LUAD进展的关键通路.