基于SLAF-seq玉米高密度遗传连锁图谱构建与株型性状QTL定位

• 作者: 薛春雷 吴慧 逯晓萍 韩平安 孙峰成 张来厚
• 来源期刊: 科技导报
• 关键词: 玉米 SLAF-seq技术 高通量测序 高密度遗传连锁图谱 株型
• 年，卷（期）: 2021,（14）
• 所属期刊栏目: 研究论文|Papers
• 页码范围: 144-154
• 页数: 11页
• 语种: 中文

摘要

株型直接决定生物产量、种植密度与籽粒产量,利用玉米高密度遗传连锁图谱解析株型相关性状的遗传机制,对选育理想株型玉米新品种具有重要意义.本研究利用SLAF-seq技术,依据玉米黄早四参考基因组信息,对昌7-2与PHB1M及其138个F2:3家系高通量测序,开发高密度SNP的遗传图谱,并进行株型相关性状QTL定位.研究结果构建了一张总图距为1354.81 cM,标记间的平均距离为0.32 cM,标记数为4220个SLAF标签(7876个SNP)的高密度遗传图谱.在E1与E2两种密度下,对株高、穗位、叶片数、节间数、平均节间长进行QTL定位,共检测到10个QTL位点,其中,有7个PVE超过了10％.叶片数、穗位、节间数为主效QTL,ADD为负值,叶片数与节间数的减效等位基因来源于PHB1M,穗位的减效等位基因来源于昌7-2.叶片数与节间数在2个密度下均定位在8号染色体上,说明二者之间有着共同的遗传机制.与QTL关联的SLAF标记共有61个,其中,SLFA7305498和SLFA6717271为qLC-2-LG8与qIC-2-LG8共有标记.该研究将为玉米株型相关性状的标记辅助选择提供支撑.