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茶树树型相关CYC/TB1家族全基因组鉴定及表达分析
茶树树型相关CYC/TB1家族全基因组鉴定及表达分析
作者:
徐文鸾
钟函江
刘杏月
吴嘉怡
严安然
赵培伶
张徐杨
张群峰
倪德江
王明乐
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
茶树
TCP家族
CYC/TB1亚类
树型
表达分析
摘要:
TCP (TEOSINTE BRANCHED 1/CYCLOIDEA/PROLIFERATING CELL FACTOR)是植物所特有的一类转录因子,广泛参与调控植物的生长发育.本研究从茶树基因组中获得茶树TCP家族CYC/TB1亚类分支的4个成员,分别命名为CsTCP1、CsTCP8、CsTCP12和CsTCP18.保守结构域分析发现,它们均包含典型的TCP结构域.亚细胞定位预测表明,其编码蛋白均定位于细胞核.系统进化分析可将CYC/TB1亚类分为四个分支(CYC1、CYC2、CYC3和TB1),其中CsTCP1和CsTCP18同属于CYC1支,CsTCP8属于CYC2支,CsTCP12属于CYC3支.qRT-PCR分析发现,这四个基因在不同茶树树型不同部位中存在组织特异性表达:CsTCP1在成熟叶中表达量最高;CsTCP8主要在腋芽和嫩茎中表达;CsTCP12的表达量较低,在多个品种中未检出;而Cs TCP18在6个茶树品种的各部位均有表达,但有一定差异,推测该亚族基因可能参与茶树的腋芽生长并调控茶树分枝.进一步对缺氮条件下这四个基因的表达量分析发现,CsTCP1在新梢中的表达量逐渐降低;CsTCP8的表达先升高后降低;CsTCP18的表达趋势与CsTCP8相反,表达量在缺氮12 h时达到最高;而Cs TCP12的表达量较低,在缺氮条件下未被检出,推测该亚族基因可能参与缺氮响应.
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文献信息
篇名
茶树树型相关CYC/TB1家族全基因组鉴定及表达分析
来源期刊
植物生理学报
学科
关键词
茶树
TCP家族
CYC/TB1亚类
树型
表达分析
年,卷(期)
2021,(11)
所属期刊栏目
研究报告|Original Papers
研究方向
页码范围
2179-2191
页数
13页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13592/j.cnki.ppj.2021.0122
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
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研究主题发展历程
节点文献
茶树
TCP家族
CYC/TB1亚类
树型
表达分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
植物生理学报
主办单位:
中国植物生理学会
中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-1108
CN:
31-2055/Q
开本:
大16开
出版地:
上海市岳阳路319号31B楼
邮发代号:
4-267
创刊时间:
1951
语种:
chi
出版文献量(篇)
5646
总下载数(次)
4
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