中国红树类海桑属植物DNA条形码研究

• 作者: 孙稚颖 李强 田晓萌 郭庆梅 邵长伦
• 来源期刊: 世界科学技术-中医药现代化
• 关键词: 中国红树类 海桑属植物 ITS2 psbA-trnH DNA条形码
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 中药研究|Chinese Materia Medica
• 页码范围: 2036-2042
• 页数: 7页
• 分类号: R282.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.11842/wst.20200804002

摘要

目的 对中国的6种红树类海桑属植物进行DNA条形码研究,为该属植物鉴定、资源保护、合理开发等提供参考依据.方法 以核基因ITS2片段及叶绿体基因片段psbA-trnH作为DNA条形码,对分布在中国的海桑属植物进行基因组DNA提取、PCR扩增和双向测序.所得序列经CodonCode Aligner拼接获得叶绿体psbA-trnH基因间区序列和核ITS2序列,用软件MEGA6.0进行相关数据分析,构建NJ(邻接)树.结果 我国6种红树类海桑属植物的ITS2序列间存在明显差异,psbA-trnH序列间也存在一定的碱基差异,表明6种海桑属植物具有其各自独特的DNA条形码,可以相互区别,同时基于ITS2序列及psbA-trnH序列构建的邻接(NJ)树可以看出6种海桑属植物具有或近或远的亲缘关系.结论 核ITS2和叶绿体psbA-trnH序列作为DNA条形码可以有效地区分和鉴别我国6种红树类海桑属植物,为后续药用资源开发等相关研究提供了参考.