硒处理下冰菜的转录组响应及相关基因功能分析

• 作者: 姚运法 练冬梅 林碧珍 赖正锋 洪建基
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 冰菜 转录组 差异表达基因 植物激素信号转导途径
• 年，卷（期）: 2021,（12）
• 所属期刊栏目: 园艺·农业生态环境|HORTICULTURE·AGRICULTURAL ECO-ENVIRONMENT
• 页码范围: 2737-2747
• 页数: 11页
• 分类号: S641.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2021.12.026

摘要

[目的]探索外源硒对冰菜转录组相应机制影响及相关功能基因挖掘.[方法]利用高通量测序技术,构建冰菜硒响应转录组数据库.[结果]硒处理对冰菜植物激素信号转导途径影响:除油菜素类固醇外,其它7个激素代谢途径均产生重要影响.硒处理浓度的增加,能够促进生长素信号转导,激活下游基因表达;细胞分裂素信号转导途径中,AHP对硒处理敏感,A-ARR受硒处理呈显著上调作用,但均对硒浓度变化不敏感;硒处理浓度增加,使得赤霉素信号转导下游TF得到激活;脱落酸信号转导途径中,低硒处理(10 mmol/L)导致SnRK2表达量显著降低,抑制气孔关闭,导致冰菜易脱水;硒处理(100 mmol/L) SnRK2蛋白表达量显著恢复;乙烯信号转导途径中ETR和ERF1/2表达量随着硒处理浓度的提高而降低;硒处理(10 mmol/L)促进茉莉酸信号途径中JAZ和MYC2表达量上调,调节硒对冰菜的逆境胁迫,硒处理(10 mmol/L)对JAZ和MYC2表达量影响不显著;水杨酸信号转导途径中TGA和PR-1在硒处理(10 mmol/L)表达量无上下调表达,硒处理(100 mmol/L) TGA表达量下调,PR-1表达量上调,激活冰菜硒响应能力.经实时定量PCR分析,7个DEGs相对表达量与转录组表达谱分析趋势完全一致.[结论]本研究为冰菜硒关键基因挖掘和遗传育种奠定了一定基础.