苦荞二磷酸尿核苷-半乳糖转运载体FtUTR的鉴定与分析

• 作者: 石桃雄 汪燕 梁成刚 韦春玉 关志秀 黄娟 朱丽伟
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 关键词: 苦荞 二磷酸尿核苷-半乳糖转运体 蛋白序列分析 基因表达
• 年，卷（期）: 2021,（15）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 53-57
• 页数: 5页
• 分类号: S517.01
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2021.15.009

摘要

植物二磷酸尿核苷-半乳糖转运蛋白(UDP-galactose transporter,UTR)参与介导UDP-半乳糖的跨膜运输,对于高尔基体内非纤维素多糖和糖蛋白合成至关重要.为了给苦荞糖运输及调控机制研究提供科学参考,本研究基于基因功能注释与同源基因比对,鉴定到9个苦荞FtUTR基因,其序列长度在1920～5975 bp间,氨基酸残基在81～352个间.FtUTR氨基酸序列的一致性为19.14％,说明苦荞不同FtUTR蛋白间序列保守性较低.但多个苦荞FtUTR可分别与同源的拟南芥AtUTR聚在一起,说明不同物种间UTR蛋白的进化关系较为紧密.基于茎的转录组测序鉴定到5个差异表达基因(DEGs),其中FtPinG0001931200.01在出苗后5 d高表达;FtPinG0001901300.01和FtPinG0002689200.01在出苗后10 d高表达;FtPinG0001931400.01和FtPinG0001052700.01在出苗后15 d高表达,推测它们可能在幼苗的特定发育阶段发挥作用.另外,幼苗发育过程中苦荞DEGs的表达量存在多个显著正相关或负相关关系.本研究结果可为下一步深入探索苦荞FtUTR调控UDP-半乳糖运输以及生长发育提供基础.