茎瘤芥异戊烯基转移酶家族基因全基因组鉴定及表达分析

• 作者: 蔡兆明 程春红 廖静静 王殿东
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 茎瘤芥 异戊烯基转移酶 盐胁迫 根肿菌 基因家族
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 38-47
• 页数: 10页
• 分类号: Q786|Q789
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2022.01.0038

摘要

该研究以茎瘤芥栽培品种'永安小叶'为实验材料,在全基因组水平对茎瘤芥基因组中异戊烯基转移酶(IPT)家族基因成员进行鉴定;通过荧光定量PCR检测各基因在不同组织、盐胁迫和根肿菌胁迫条件下的表达模式.结果 显示:(1)在茎瘤芥基因组中共鉴定到27个IPT家族基因,分布在14条染色体上,它们在系统进化树中可聚类为7个分支.(2)大部分IPT家族基因主要在茎瘤芥的根和茎中表达,在叶片、花和种荚中表达量相对较低.BjuB006281在茎中的表达水平最高,BjuA027211、BjuB010173、BjuB010174和BjuA001839在根中的表达水平较高.(3)大部分的IPT基因表达受盐胁迫抑制,BjuB006281、BjuA036403、BjuB010173、BjuB026254在盐胁迫12～48 h显著下调表达;BjuB022918和BjuB007352则在盐胁迫24～48 h显著下调表达.(4)大部分茎瘤芥IPT基因在12h受到根肿菌侵染的显著诱导,其中BjuB006281、BjuA014415、BjuB022918在侵染后12h的表达水平为0h对照的15倍以上.该研究鉴定出多个响应盐胁迫和根肿菌胁迫的IPT基因,为进一步研究他们的基因功能奠定了基础.