玉米LEC1基因家族的鉴定与生物信息学分析

• 作者: 刘畅畅 黄敏
• 来源期刊: 甘肃农业科技
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 LEC1基因家族 生物信息学
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种|Genetic Breeding
• 页码范围: 31-37
• 页数: 7页
• 分类号: S513
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-1463.2022.01.007

摘要

LEC基因家族包含LEC1和LEC2,参与植物的生长发育及储藏物质的积累.LEC1(Leafy Cotyledon 1)是NF-YB9蛋白家族的成员,编码了CCAAT-box结合转录因子HAP3(Heme activated protein 3)亚单位.利用生物信息学方法,获得了16个玉米LEC1基因.分析发现,ZmLEC1蛋白大部分都是酸性的不稳定亲水蛋白,含有1个保守结构域CBFD_NFYB_HMF及10个保守基序.通过与拟南芥LEC1基因和水稻LEC1基因的聚类分析,将玉米LEC1基因家族分为4类:ClassⅠ、ClassⅡ、ClassⅢ、ClassⅣ.经RNA-seq等分析发现,玉米LEC1家族基因具有组织特异性,响应非生物胁迫.启动子分析发现,玉米LEC1基因启动子上含有响应激素和非生物胁迫的顺式作用元件.