沙棘CAT家族基因的生物信息学分析

• 作者: 徐世琦 朱元玲 李贺 邓伊亦 邓金兰
• 来源期刊: 天津农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 沙棘果实 氨基酸转运体 家族基因 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 植物生理与生物技术
• 页码范围: 1-4
• 页数: 4页
• 分类号: S663.9
• 字数: 2377字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-6500.2019.05.001

摘要

CAT (Cationic amino acid transporters)是植物体内参与氨基酸的吸收与转运的一类跨膜转运蛋白.为探究CAT家族基因及其所编码蛋白的结构特征,本研究依据前期所获得的不同发育期沙棘果实的转录组测序数据,经过功能注释与分析后获得3个CAT家族成员基因,分别命名为HrCATI、HrCAT2和HrCAT3,并对其进行生物信息学分析.结果 表明,沙棘果实HrCAT家族基因均含有完整的开放阅读框,编码二级结构以α-螺旋为主、不含信号肽的非分泌蛋白,其中HrCAT1和HrCAT2蛋白的三级结构之间具有较高相似性.研究结果可为后续研究沙棘果肉HrCAT基因的表达调控提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李贺	大连民族大学环境与资源学院	25	154	7.0	12.0
2	邓金兰	大连民族大学环境与资源学院	2	0	0.0	0.0
3	徐世琦	大连民族大学环境与资源学院	2	0	0.0	0.0
4	邓伊亦	大连民族大学环境与资源学院	1	0	0.0	0.0
5	朱元玲	大连民族大学环境与资源学院	1	0	0.0	0.0