紫鸭跖草热激转录因子基因家族鉴定及在Cu2+胁迫下表达模式分析

• 作者: 彭国颖 卢山 杨坤 万玮 黄长干
• 来源期刊: 生物工程学报
• 关键词: 紫鸭跖草 热激转录因子 生物信息学 表达分析
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 环境生物技术|Environmental Biotechnology
• 页码范围: 238-251
• 页数: 14页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13345/j.cjb.210012

摘要

热激转录因子(Hsf)是植物中最重要的转录因子家族之一,在植物遭遇热、干旱和重金属等多种非生物胁迫中具有重要的作用.为明确紫鸭跖草Hsf基因家族的结构及功能,从紫鸭跖草全长转录组数据库筛选鉴定出20个SpbHsf基因,并运用生物信息学工具和qRT-PCR进行分析.结果 显示:SpbHsf蛋白均为亲水性蛋白,定位于细胞核的SpbHsf蛋白有12个,所有SpbHsf蛋白二级结构的α螺旋和无规卷曲的含量较高.SpbHsf基因分为3个亚族,各亚族都包含独特的保守基序.全部SpbHsf蛋白含有DBD和HR-A/B结构域.系统进化分析显示,与SpbHsf蛋白同源性最高的是水稻OsHsf蛋白.20个SpbHsf基因在紫鸭跖草根组织中均有表达.相比于对照组,根组织在Cu2+胁迫下,8个SpbHsf基因的表达量显著上调,8个SpbHsf基因的表达量显著下调.研究结果为紫鸭跖草Hsf基因家族的功能验证及表达模式提供了一定的理论参考.