利用支持向量机预测Ⅱ类MHC分子结合多肽

• 作者: 乔立安 公衍道 胡磊 赵南明
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 主要组织相容性复合体(MHC) 人类白细胞抗原(HLA) 支持向量机(SVM) 预测
• 年，卷（期）: 2001,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 669-675
• 页数: 7页
• 分类号: Q617
• 字数: 3850字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-6737.2001.04.010

摘要

抗原多肽序列与主要组织相容性复合体(MHC)分子的结合是引起T细胞免疫应答的先决条件.对结合多肽序列的预测可以大大减少实验所需的费用和时间.我们用支持向量机(SVM)对HLA DR4(B1*0401)编码的Ⅱ类MHC分子结合多肽进行了预测,将650个已知结合能力的多肽序列,按3:1的比例分成训练组和测试组进行训练和测试.对结合多肽,预测的准确率达到77.62%,对不结合多肽,准确率达到71.79%.这表明SVM方法鉴定用于免疫疗法的多肽片段是可行的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	公衍道	清华大学生物系生物膜与膜生物物理国家重点实验室	22	179	7.0	13.0
2	赵南明	清华大学生物系生物膜与膜生物物理国家重点实验室	32	786	14.0	28.0
3	乔立安	清华大学生物系生物膜与膜生物物理国家重点实验室	2	16	2.0	2.0
4	胡磊	清华大学生物系生物膜与膜生物物理国家重点实验室	3	18	2.0	3.0