1株中国人HCV一2a型基因组部分cDNA序列的种系发生树分析

• 作者: 徐德忠 李如琳 杨国琦 杨海 赵小宁 霍艳英
• 来源期刊: 中国公共卫生
• 学科: 医学
• 关键词: 丙型肝炎病毒 病毒基因 种系发生树
• 年，卷（期）: 2001,（9）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 769-771
• 页数: 3页
• 分类号: R115
• 字数: 2872字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1001-0580.2001.09.001

摘要

用反转录套式PCR(RT-PCR)法从陕西地区1例NANB型肝炎患者血清中扩增出部分E区的cDNA片段,克隆于PG-EM-T载体中用全自动序列分析仪进行双向测序,测得的序列以及已发表的同一分离株5＇NRC、C区序列,分别同Genbank中注册的36株已知基因型的HCV相应区段的序列比较,构建种系发生树.结果5＇NCR区相应序列构建的种系发生树表明该分离株为2型,而用C区和E区构建的种系发生树均表明该分离株为2a型.提示该分离株为2a型;对同一病原体来说,其基因区段的变异度不同,则种系发生树分析的结果不完全相同,变异度大的结果较准确.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐德忠	第四军医大学流行病学教研室	165	1677	21.0	30.0
2	霍艳英	第四军医大学流行病学教研室	3	1	1.0	1.0
3	赵小宁	第四军医大学流行病学教研室	3	1	1.0	1.0
4	李如琳	第四军医大学流行病学教研室	7	12	2.0	3.0
5	杨海		4	3	1.0	1.0
6	杨国琦		1	0	0.0	0.0