犬腺病毒纤突蛋白基因功能区的比较分析

• 作者: 乔军 何洪彬 余春 夏咸柱 武银莲 殷震 范泉水 邱薇 黄耕
• 来源期刊: 中国预防兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 犬腺病毒 纤突蛋白 纤突结构功能区/纤突结、轴和尾区
• 年，卷（期）: 2002,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 93-96
• 页数: 4页
• 分类号: S852.65+9.1|Q78
• 字数: 1963字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0589.2002.02.003

摘要

根据GenBank中已发表的CAV纤突基因序列,设计合成4对8条引物,用已建立的PCR方法,对犬2型腺病毒沈阳分离株第5代强毒经蚀斑克隆驯化的第60代毒弱毒(SY-V60)和犬1型腺病毒长春犬株(CCC-V6)的纤突基因进行了扩增,PCR产物经纯化后进行基因序列测定,测定结果经拼接后得到一个由1632和1629个核苷酸组成的纤突蛋白全基因序列,分别编码543和542个氨基酸.犬2型腺病毒(SY-V60)与犬1型腺病毒(CCC-V6)的纤突基因的同源性达到80.48%.犬2型腺病毒(SY-V60)与犬1型腺病毒(CCC-V6)纤突基因的同源性达到80.48%;根据犬的腺病毒与人2型腺病毒纤突蛋白的序列同源性比较结果,推测了犬腺病毒纤突蛋白的尾(tail)、轴(shaft,)、结(knob)三个功能区的氨基酸序列,2个型之间的尾区同源性为76.9%;轴区同源性为78.59%;其结区同源性为83.24%,而同型毒株之间结和尾区同源性较高,轴区同源性较低.