DNA片段拼接中基于定长特征子串的重复序列信息屏蔽方法

• 作者: 张博锋 王正华
• 来源期刊: 国防科技大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 生物信息学 片段拼接 重复片段 屏蔽 定长特征子串
• 年，卷（期）: 2002,（6）
• 所属期刊栏目: 电子工程·计算机工程
• 页码范围: 67-70
• 页数: 4页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 2822字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-2486.2002.06.016

摘要

包含重复序列(repeats)的DNA序列的重构是大规模DNA片段拼接所面临的实际困难之一.在考虑片段数据所隐含的位置信息的基础上,提出了一种基于定长特征子串的屏蔽片段数据中重复序列信息的方法,即在进行序列相互比对前利用独特子串标识大多数片段,从而减少可能的错误重叠,讨论了方法中几个参数的确定问题并用计算结果说明了方法的有效性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王正华	国防科技大学并行与分布处理国家重点实验室	72	600	12.0	20.0
2	张博锋	国防科技大学并行与分布处理国家重点实验室	4	72	3.0	4.0