茶树紫黄素脱环氧化酶基因的cDNA克隆及其生物信息学分析

• 作者: 宛晓春 江昌俊 陶汉之 韦朝领
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 紫黄素脱环氧化酶 cDNA 生物信息学 叶黄素循环
• 年，卷（期）: 2003,（1）
• 页码范围: 14-19
• 页数: 6页
• 分类号: S571.1|Q781
• 字数: 4738字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-2030.2003.01.004

摘要

根据GenBank中已登录的植物紫黄素脱环氧化酶(VDE)基因序列,以其高度保守的氨基酸序列设计一对简并引物,采用RT-PCR与3′/5′-RACE相结合的方法, 从茶树(Camellia sinensi)中克隆出VDE的全长cDNA,长度为1 632 bp.分析表明,该序列的5′-端和3′-端的非编码序列长度分别为61 bp和140 bp,开放阅读框为1 422 bp,编码473个氨基酸,其转运肽长度为132个氨基酸.成熟蛋白的氨基酸序列与拟南芥、莴苣、菠菜及烟草的同源性分别为83.5%,82.7%,82.1%和83.6%,且有3个特殊的结构域:半胱氨酸富集区、脂肪结合蛋白特征区和由谷氨酸富集的高电荷区.分析表明,茶树VDE具有热稳定性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	江昌俊	安徽农业大学农业部茶叶生物技术重点开放实验室	104	1931	22.0	40.0
2	宛晓春	安徽农业大学农业部茶叶生物技术重点开放实验室	162	3012	29.0	46.0
3	韦朝领	安徽农业大学农业部茶叶生物技术重点开放实验室	49	905	15.0	29.0
4	陶汉之	安徽农业大学农业部茶叶生物技术重点开放实验室	8	291	7.0	8.0