胶质瘤诱导分化相关基因的生物信息学分析

• 作者: 兰青 孙立军 孙继勇 王爱东 董军 黄强
• 来源期刊: 中华实验外科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 胶质瘤 分化 基因表达
• 年，卷（期）: 2003,（4）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 364-366
• 页数: 3页
• 分类号: R73
• 字数: 2959字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j.issn:1001-9030.2003.04.034

摘要

目的探讨胶质瘤诱导分化的分子调控机制,寻找与分化过程密切相关的关键基因.方法苯丁酸钠诱导SHG-44-9胶质瘤细胞株,诱导前和诱导2h、6d后作cDNA微阵列建立基因表达谱,然后利用生物信息学工具对表达谱数据做系统的聚类分析和生物信息库检索.结果对差异2倍以上的115个基因作聚类分析,得到6大类不同表达模式的基因类别.进一步生物信息学分析表明,其中有11条基因的功能信息与诱导分化关系密切,可能是这一过程的关键基因.结论生物信息学是分析基因表达谱的有力工具,可以很好的从表达谱数据提取出与诱导分化相关的关键基因,可供进一步研究.