拟南芥和线虫基因序列及剪切位点的理论预测

• 作者: 李前忠 林昊 陈翠霞
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 外显子 内含子 基因间序列 煎切位点 离散增量
• 年，卷（期）: 2004,（2）
• 所属期刊栏目: 生物信息学
• 页码范围: 125-131
• 页数: 7页
• 分类号: Q61
• 字数: 6184字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-6737.2004.02.007

摘要

将拟南芥(A.thaliana)和线虫(C.elegans)基因组按外显子、内含子及基因间序列区分为3类.分别选取64、40、20种三联体的概率作为信号参数构建离散源,根据离散增量预测序列所属类型.结果表明:拟南芥各条染色体标准集总预测成功率达到82.19%,检验集为87.95%;线虫各条染色体标准集总预测成功率达到79.67%,检验集达到81.93%.另外,将两种基因序列中的外显子分别划分成3类,用外显子剪切位点、翻译起始和结束位点附近的三联体的3个位点作为3条子链,以各条子链的12个参数构建离散源,用离散增量对3种序列类型进行预测,预测成功率都达80%以上.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李前忠	内蒙古大学理工学院物理系	87	366	11.0	15.0
2	林昊	内蒙古大学理工学院物理系	14	79	4.0	8.0
3	陈翠霞	内蒙古大学理工学院物理系	5	13	2.0	3.0