我国中部HIV-1 B'亚型分离株基因组结构特征及系统发育分析

• 作者: 冯福民 刘思杨 庄道民 李敬云 李林 鲍作义
• 来源期刊: 中国病毒学
• 学科: 医学
• 关键词: Ⅰ型艾滋病病毒 基因组 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2004,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 444-448
• 页数: 5页
• 分类号: R511
• 字数: 4144字
• 语种: 英文

摘要

为了分析河南省Human immunodeficiency virus-1(HIV-1)流行株的基因特征和传染来源,我们从一位HIV-1感染的有偿献血员体内分离HIV-1毒株.提取感染细胞的全基因组DNA,扩增病毒全基因组,Walking法测得全长序列.与HIV-1 RL42和HIV-1 HXB2株比较,分析基因特征.用Anthewin软件比较分析CNHN24株和RL42株env蛋白的二级结构.用Clustal软件对国内HIV-1分离株和国际参考株的全基因组、env基因和V3环基因分别进行了系统发育分析.结果发现,CNHN24株为HIV-1 B'亚型,富含嘌呤,含量达到60.26%.与RL42株及HXB2株比较,pol基因和gag基因变异度较小,env基因及非结构基因变异度较大.与RL42株相比,env蛋白二级结构变异不大,但env保守区C4的氨基酸呈高度变异.系统发育分析显示,CNHN24株与RL42株遗传距离最近,HIV-1Lai株和HXB2株次之,与国内的HIV-1 B/C及AE/BC重组毒株的遗传距离较远;从V3序列的比较可以发现,CNHN24株与来自云南省的毒株HIV-1 CR206及RL42遗传距离最近.认为HIV-1 CNHN24株可能由云南传入.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李敬云	军事医学科学院微生物流行病研究所	62	337	12.0	15.0
2	鲍作义	军事医学科学院微生物流行病研究所	34	223	9.0	13.0
3	李林	军事医学科学院微生物流行病研究所	17	249	7.0	15.0
4	庄道民	军事医学科学院微生物流行病研究所	15	95	5.0	9.0
5	冯福民	军事医学科学院微生物流行病研究所	2	6	2.0	2.0
6	刘思杨	军事医学科学院微生物流行病研究所	2	4	1.0	2.0