犬冠状病毒V1株膜蛋白基因的克隆与序列分析

• 作者: 乔军 夏咸柱 杨松涛 胡桂学 谢之景 闫芳 黄耕
• 来源期刊: 西北农林科技大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 犬冠状病毒 膜蛋白基因 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2004,（12）
• 页码范围: 75-78
• 页数: 4页
• 分类号: S858.292|S852.65+9.6
• 字数: 2484字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1671-9387.2004.12.016

摘要

根据GenBank中报道的CCV Insavc-1株核蛋白基因(M)序列,用特异性引物对分离的CCV V1野毒株进行了RT-PCR扩增,将扩增得到的PCR片段纯化后与pGEM-T连接得到重组质粒pTM,并进行了核苷酸序列测定.结果表明,该基因全长为789 bp,编码263个氨基酸,其中前17个氨基酸为信号肽.与CCV标准毒株Insavc-1 M基因相比,两者核苷酸的同源性为92.1%;推导的氨基酸序列同源性为90.9%,差异主要发生在该蛋白的N端前1/3区域内.在推导的M蛋白氨基酸序列中,发现了3个明显的疏水区,提示该蛋白可能是一个反复跨膜的蛋白;在N端15～17,38～40,234～236位氨基酸存在3个潜在的N-联糖基化位点,可能是形成该蛋白表面抗原决定基的位点.另外,推导蛋白氨基酸序列的疏水性和抗原表位与Insavc-1株M蛋白存在一定差异,提示两者免疫原性可能有差别.