基于多级优化的真核生物基因结构预测

• 作者: 万宏辉 周艳红 杨雷 王卉 陆枫
• 来源期刊: 科学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 真核生物 DNA序列 基因结构预测 蛋白质编码区预测 多级优化
• 年，卷（期）: 2004,（2）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 140-145
• 页数: 6页
• 分类号: Q81
• 字数: 7445字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0023-074X.2004.02.007

摘要

基因结构预测对于发现新基因、了解基因组结构规律具有重要作用, 是各类基因组计划的重要内容. 但对于真核生物, 现有基因预测方法的效果仍不理想. 为探讨多级优化的真核生物基因结构预测方法, 在将复杂的多基因结构预测问题划分为基因级(单外显子基因、多外显子基因)、元件级(外显子、内含子等)和特征级(功能位点信号、密码子使用偏好等)等多个层次上的一系列较简单子问题的基础上, 通过从简单到复杂进行逐级优化的策略, 建立了基因结构预测的多级模型, 设计了基因结构寻优的动态规划算法, 开发了真核生物基因结构预测系统GeneKey(1.0). 用广泛采用的数据集对该系统进行测试的结果表明, GeneKey(1.0)的预测精度在核苷酸、外显子和基因水平上均高于著名系统GENSCAN. Gene- Key(1.0)已提供网上服务(http://infosci.hust.edu.cn).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周艳红	华中科技大学计算机科学与技术学院	26	243	9.0	15.0
5	王卉	华中科技大学生命科学与技术学院	22	125	7.0	11.0
6	陆枫	华中科技大学计算机科学与技术学院	15	81	6.0	8.0
7	杨雷	华中科技大学计算机科学与技术学院	4	26	3.0	4.0